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Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)

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通過分析單細胞或克降的功能、表型和基因型,一次實驗快速篩選幾千到幾萬個單細胞,深入理解細胞功能,加速新療法的開發(fā)。

一:技術(shù)原理:

布魯克的光流控技術(shù)(Optofluidic Technology)是集納升級微反應(yīng)器技術(shù)(NanoPen™)光電定位技術(shù)( OptoelectroPositioning,OEP™)、及AI算法為一體的劃時代數(shù)字細胞生物學(xué)技術(shù)。在一塊CPU大小的半導(dǎo)體芯片上,單個活細胞可通過微反應(yīng)器技術(shù)在納升級的小室中進行培養(yǎng)及實驗,并可通過光電定位技術(shù)進行靈活的導(dǎo)入和導(dǎo)出。細胞的性狀、實驗結(jié)果分析等通過AI算法精密計算,實現(xiàn)了全自動化操作。

圖片1.png

納升級微反應(yīng)器技術(shù):OptoSelect芯片上有數(shù)千到上萬個納升級別的NanoPen小室,小室上方是試劑和細胞的通道,在培養(yǎng)基流動過程中,小室中的細胞和微珠等不會受到通道層流的干擾,小分子包括營養(yǎng)物質(zhì)和代謝產(chǎn)物可以通過濃度梯度擴散實現(xiàn)細胞的持續(xù)培養(yǎng),抗體和細胞因子等大分子則可以在十幾分鐘內(nèi)在小室內(nèi)積累到可被檢測的濃度,從而實現(xiàn)對單個細胞快速表征。


圖片3.png

二:應(yīng)用領(lǐng)域

1、抗病毒中和抗體發(fā)現(xiàn)

目前獲得抗病毒中和抗體有三種策略:1,從康復(fù)病人血液中獲得;2,用病毒蛋白免疫小鼠通過通過抗體發(fā)現(xiàn)過程獲得;3,通過篩選人天然抗體庫獲得。其中通過第1種策略獲得的中和抗體效果好,耗時短。將從康復(fù)病人血液中富集的B細胞進行單個B 細胞水平的篩選及測序,從而快速高效地獲得抗病毒中和抗體。單個B細胞抗體發(fā)現(xiàn)具有很多優(yōu)勢,成為抗體發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的熱門新方向,但受限于常規(guī)技術(shù)平臺難以實現(xiàn)單個B細胞的分離,篩選和回收。Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)將單個B細胞導(dǎo)入到芯片中的納升級培養(yǎng)小室(NanoPen)中后,可平行檢測抗原特異性抗體的分泌,并進行相關(guān)功能性驗證,并針對性的導(dǎo)出目標B細胞。配合下游的單細胞mRNA測序,可在兩天內(nèi)完成細胞表型篩選并得到相應(yīng)的抗體重輕鏈序列。相較于傳統(tǒng)的抗體制備技術(shù), Beacon平臺具有細胞利用率高,回收效率高,支持人源化,重鏈和輕鏈序列信息配對等優(yōu)勢。

2、抗體工程

抗體藥物研發(fā)過程中,為使篩選后得到的抗體具有理想的結(jié)構(gòu)和活性,往往需要進行多輪的改造和優(yōu)化。如通過基因工程的手段對抗體基因進行加工改造、轉(zhuǎn)染到工程細胞重新裝配、并進行功能篩選和分析,以便確認該改造是否符合需求。傳統(tǒng)轉(zhuǎn)染后篩選需要數(shù)周時間,而Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)僅需 3-5 天即可實現(xiàn),極大地節(jié)省了抗體工程優(yōu)化流程的時間成本。

3、腫瘤免疫治療

在腫瘤免疫治療中,為了驗證細胞的改造效率,優(yōu)化治療用細胞的劑量,業(yè)界一直在尋找一種可對改造后T淋巴細胞進行高效篩選驗證的技術(shù)手段。Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)可以實現(xiàn)對T淋巴細胞進行特異性激活,并檢測特定細胞因子的分泌,從而實現(xiàn)對T淋巴細胞的功能性篩選。篩選后導(dǎo)出T淋巴細胞,可配合下游的基因表達譜分析(gene profiling),T細胞受體測序(TCR sequencing),T 細胞受體改造(TCR engineering)等 手段,大幅提升篩選效率。

4、基因編輯

基因編輯技術(shù)是免疫學(xué)、細胞生物學(xué)等學(xué)科的重要研究手段,也是物種改良、疾病預(yù)防、治病治療等領(lǐng)域的重要途徑。常規(guī)基因編輯實驗過程中,在轉(zhuǎn)染后的篩選過程中,需要 1-2 個月進行大量鋪板、利用成像或生化等手段進行單克隆篩選和鑒定,而 Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)僅需 5 天,即可在更大規(guī)模地全自動地篩選所需的目標克隆,即可提高實驗效率、節(jié)省人力成本,也可得到更可靠詳實的實驗成果。

5、細胞共培養(yǎng)研究

體外細胞共培養(yǎng)(cell co-culture)技術(shù)能模擬體內(nèi)生成的微環(huán)境,便于更好地觀察細胞與細胞、細胞與培養(yǎng)環(huán)境之間的相互作用以及探討藥物的作用機制和可能的作用靶點。Beacon 單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)因其精準的細胞操作和高通量,可以為體外細胞共培養(yǎng)提供更多研究手段,如細胞間的殺傷、吞噬、協(xié)同等實驗策略。

6、細胞克隆和亞克隆

有限稀釋,流式分選等方法是細胞克隆的常見手段,在將細胞分到數(shù)十塊微孔板后,還需要人工通過顯微鏡逐個檢查是否為單細胞、通過成像系統(tǒng)來判斷或通過生化手段來鑒定,每輪需要 3-4 周,根據(jù)不同應(yīng)用單克隆性要求的不同,需要采用1至2輪的克隆步驟,整個過程極其繁瑣費時,且誤操作可能性較大。而Beacon單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)則可以在5天內(nèi)實現(xiàn)全自動細胞克隆和回收,輕松獲得單克隆比例達99.5%的優(yōu)質(zhì)克隆。其全程配備圖像和影像記錄,并可以設(shè)計功能性驗證環(huán)節(jié)。利用Beacon單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)在芯片上同樣也可以進行亞克隆,只需將芯片上特定NanoPen中單克隆的部分細胞分離導(dǎo)出,擴大培養(yǎng),便可輕松實現(xiàn)克隆與亞克隆的平行培養(yǎng)。

7、表型與基因型對應(yīng)

表型和基因型的對應(yīng)一直是免疫學(xué)和細胞生物學(xué)研究的痛點之一,具有操作復(fù)雜、準確度不高、需要耗費大量人力物力等困難。而Beacon單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)由于可以定制化定向?qū)С,可以解決這個問題。在完成對單克隆的表現(xiàn)檢測后,Beacon支持將特定克隆進行定向?qū)С,配合下游的基因測序數(shù)據(jù),直接對接表型數(shù)據(jù)和基因型數(shù)據(jù)。同時,Beacon單細胞光導(dǎo)系統(tǒng)也支持對于單克隆的亞克隆的導(dǎo)出,在對部分亞克隆進行測序的同時,繼續(xù)培養(yǎng)原單克隆,并進行更多的生化分析,極大的豐富了從同一單克隆樣品中可獲取的數(shù)據(jù)種類。


三:技術(shù)優(yōu)勢

1、精準無損的單細胞操作:可利用光電定位系統(tǒng),同時輕松操作數(shù)千個單細胞,  并進行平行的培養(yǎng),分析等研究。

2、通量高:可同時運行4張芯片,約50000個細胞。并支持多種芯片類型,靈活的滿足不同通量的實驗需求。

3、全自動:細胞導(dǎo)入,培養(yǎng),克隆,亞克隆,檢測,篩選全部為自動化流程,較大程度的避免了手工操作帶來的可能誤差或錯誤。

4、軟件易用:觸摸屏操作,圖形化界面,實驗流程設(shè)計靈活,直觀,易上手。

5、大幅節(jié)省時間:單個B細胞抗體發(fā)現(xiàn)流程從常規(guī)3-6個月縮減至2天;克隆流程從常規(guī)2-3周縮減至約3天。

6、高靈敏度:常規(guī)單個細胞置于微孔板中,需要培養(yǎng)數(shù)周,達到一定密度后才能進行分泌蛋白等指標的檢測;而Beacon每個NanoPen體積僅有0.5-1 nl,單個細胞置于其中,密度等同于1E6 cell/ml,因此易于檢測,靈敏度高。


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